DOI:
10.37988/1811-153X_2024_4_76Сравнительная характеристика видового состава микробиома ротовой полости у пациентов с гингивитом и пародонтитом
Загрузки
Аннотация
Микробиота ротовой полости человека по видовому разнообразию уступает только сообществу микроорганизмов желудочно-кишечного тракта, играя важную роль в поддержании здоровья полости рта и организма в целом. Накопление бактериального налета на зубах и деснах вызывает воспалительный процесс, который является основным патогенетическим фактором разрушения тканей пародонта и возникновения пародонтита. Цель исследования — сравнительная характеристика видового состава микробиомов содержимого десневой борозды и пародонтальных карманов у пациентов с гингивитом и хроническим генерализованным пародонтитом (ХГП).Материалы и методы. Изучены микробиомы содержимого десневой борозды и пародонтальных карманов у 156 человек от 26 до 59 лет: 37 пациентов с гингивитом, 93 с ХГП, 26 здоровых людей (группа сравнения). Секвенирование проводили в соответствии с протоколом Illumina по подготовке 16S-метагеномных библиотек.
Результаты. В исследуемом материале были идентифицированы 10 филумов, из них чаще всего встречались представители типов Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidota. Филумы типов Spirochaetes, Actinobacteria и Synergistetes были обнаружены только в содержимом пародонтальных карманов у пациентов с хроническим пародонтитом. У пациентов с заболеваниями пародонта идентифицированные консорциумы микроорганизмов в различной комбинации видов Gemella haemolysans, Streptococcus anginosus, Aggregatibacter segnis и Porphyromonas gingivalis. Treponema denticola, Tannerella forsythia, Capnocytophaga sputigena, Filifactor alocis, Desulfobulbus sp. могут стать новыми биомаркерами заболеваний пародонта. Полученные результаты свидетельствуют о существенных изменениях оральной микробиоты у пациентов с гингивитом и пародонтитом в сравнении со здоровыми людьми, причем в ее составе встречаются не отдельные микроорганизмы, а их сообщества, которые могут играть решающую роль в патогенезе воспалительных заболеваний пародонта.
Заключение. Представленные данные обосновывают целесообразность проведения современных метагеномных исследований у пациентов с заболеваниями пародонта, что дает возможность изучения микробного состава, идентификации новых пародонтопатогенов, их взаимодействия, синергических способностей и других характеристик. Такая информация необходима для разработки более эффективных способов предотвращения образования зубного налета, поддержания естественного разнообразия резидентной микробиоты, профилактики и комплексного лечения воспалительных заболеваний пародонта.
Ключевые слова:
гингивит, пародонтит, микробиом ротовой полости, секвенирование, Filifactor alocis, Porphyromonas gingivalisДля цитирования
[1]
Гимранова И.А., Гриценко В.А., Акмалова Г.М. Сравнительная характеристика видового состава микробиома ротовой полости у пациентов с гингивитом и пародонтитом. — Клиническая стоматология. — 2024; 27 (4): 76—81. DOI: 10.37988/1811-153X_2024_4_76
Список литературы
- Hajishengallis G., Lamont R.J. Beyond the red complex and into more complexity: the polymicrobial synergy and dysbiosis (PSD) model of periodontal disease etiology. — Mol Oral Microbiol. — 2012; 27 (6): 409—19. PMID: 23134607
- Di Stefano M., Polizzi A., Santonocito S., Romano A., Lombardi T., Isola G. Impact of oral microbiome in periodontal health and periodontitis: A critical review on prevention and treatment. — Int J Mol Sci. — 2022; 23 (9): 5142. PMID: 35563531
- Trombelli L., Farina R., Silva C.O., Tatakis D.N. Plaque-induced gingivitis: Case definition and diagnostic considerations. — J Periodontol. — 2018; 89 Suppl 1: S46-S73. PMID: 29926936
- Ramseier C.A., Anerud A., Dulac M., Lulic M., Cullinan M.P., Seymour G.J., Faddy M.J., Bürgin W., Schätzle M., Lang N.P. Natural history of periodontitis: Disease progression and tooth loss over 40 years. — J Clin Periodontol. — 2017; 44 (12): 1182—1191. PMID: 28733997
- Teles F., Wang Y., Hajishengallis G., Hasturk H., Marchesan J.T. Impact of systemic factors in shaping the periodontal microbiome. — Periodontol 2000. — 2021; 85 (1): 126—160. PMID: 33226693
- Nazir M.A. Prevalence of periodontal disease, its association with systemic diseases and prevention. — Int J Health Sci (Qassim). — 2017; 11 (2): 72—80. PMID: 28539867
- Tsai C.Y., Tang C.Y., Tan T.S., Chen K.H., Liao K.H., Liou M.L. Subgingival microbiota in individuals with severe chronic periodontitis. — J Microbiol Immunol Infect. — 2018; 51 (2): 226—234. PMID: 27262209
- Huang Y., Zhao X., Cui L., Huang S. Metagenomic and metatranscriptomic insight into oral biofilms in periodontitis and related systemic diseases. — Front Microbiol. — 2021; 12: 728585. PMID: 34721325
- Callahan B.J., McMurdie P.J., Rosen M.J., Han A.W., Johnson A.J., Holmes S.P. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. — Nat Methods. — 2016; 13 (7): 581—3. PMID: 27214047
- Wang Q., Garrity G.M., Tiedje J.M., Cole J.R. Naive Bayesian classifier for rapid assignment of rRNA sequences into the new bacterial taxonomy. — Appl Environ Microbiol. — 2007; 73 (16): 5261—7. PMID: 17586664
- Quast C., Pruesse E., Yilmaz P., Gerken J., Schweer T., Yarza P., Peplies J., Glöckner F.O. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools. — Nucleic Acids Res. — 2013; 41 (Database issue): D590—6. PMID: 23193283
- Love C.J., Gubert C., Kodikara S., Kong G., Lê Cao K.A., Hannan A.J. Microbiota DNA isolation, 16S rRNA amplicon sequencing, and bioinformatic analysis for bacterial microbiome profiling of rodent fecal samples. — STAR Protoc. — 2022; 3 (4): 101772. PMID: 36313541
- Griffen A.L., Beall C.J., Campbell J.H., Firestone N.D., Kumar P.S., Yang Z.K., Podar M., Leys E.J. Distinct and complex bacterial profiles in human periodontitis and health revealed by 16S pyrosequencing. — ISME J. — 2012; 6 (6): 1176—85. PMID: 22170420
- Liu B., et al. Deep sequencing of the oral microbiome reveals signatures of periodontal disease. — PLoS One. — 2012; 7 (6): e37919. PMID: 22675498
- Schulz S., et al. Comparison of the oral microbiome of patients with generalized aggressive periodontitis and periodontitis-free subjects. — Arch Oral Biol. — 2019; 99: 169—176. PMID: 30710838
- Nearing J.T., DeClercq V., Van Limbergen J., Langille M.G.I. Assessing the variation within the oral microbiome of healthy adults. — mSphere. — 2020; 5 (5): e00451—20. PMID: 32999079
- Iniesta M., et al. Subgingival microbiome in periodontal health, gingivitis and different stages of periodontitis. — J Clin Periodontol. — 2023; 50 (7): 905—920. PMID: 36792073
- Mosaddad S.A., Tahmasebi E., et al. Oral microbial biofilms: an update. — Eur J Clin Microbiol Infect Dis. — 2019; 38 (11): 2005—2019. PMID: 31372904
- Гимранова И.А., Хакимова Л.Р., Акмалова Г.М., Газизуллина Г.Р. Современные методы диагностики заболеваний пародонта: возможности и перспективы (обзор литературы). — Клиническая лабораторная диагностика. — 2023; 9: 570—577. eLIBRARY ID: 54394051
- Гимранова И.А., Хакимова Л.Р., Акмалова Г.М., Камалова Я.А., Газизуллина Г.Р., Хлопова К.В. Культивирование Porphyromonas gingivalis, выделенных у пациентов с хроническим пародонтитом в лабораторных условиях. — Клиническая лабораторная диагностика. — 2024; 6: 272—277. eLIBRARY ID: 67224394
- Kumar P.S., et al. Changes in periodontal health status are associated with bacterial community shifts as assessed by quantitative 16S cloning and sequencing. — J Clin Microbiol. — 2006; 44 (10): 3665—73. PMID: 17021095
- Балмасова И.П., Царев В.Н., Арутюнов С.Д., Бабаев Э.А. Filifactor alocis и его роль в этиологии хронического пародонтита. — Стоматология. — 2020; 3: 78—82. eLIBRARY ID: 43044910
- Mishra A., et al. Filifactor alocis enhances survival of Porphyromonas gingivalis W83 in response to H2O2-induced stress. — Mol Oral Microbiol. — 2024; 39 (1): 12—26. PMID: 38041478
- Aruni A.W., et al. Filifactor alocis has virulence attributes that can enhance its persistence under oxidative stress conditions and mediate invasion of epithelial cells by Porphyromonas gingivalis. — Infect Immun. — 2011; 79 (10): 3872—86. PMID: 21825062
- Янушевич О.О., Царев В.Н., Балмасова И.П., Николаева Е.Н., Царева Т.В., Подпорин М.С., Ипполитов Е.В. Первый опыт применения отечественного диагностического набора генетических праймеров для выявления нового пародонтопатогена Filifactor alocis и его ассоциации с Porphyromonas gingivalis. — Клиническая лабораторная диагностика. — 2022; 12: 744—748. eLIBRARY ID: 49997611
Загрузки
Поступила
16.07.2024
Принята
02.11.2024
Опубликовано
17.12.2024